一、應用原理：
(1)通過DNA測序對微生物進行物種鑒定(菌種鑒定)是比傳統生化鑒定更先進的鑒定方法。DNA測序不依賴菌種本身特點，對所有菌種均可使用。比傳統生化鑒定更加快速，準確。微生物物種鑒定包括細菌16srDNA鑒定和真菌26S/28SrDNA鑒定、真菌ITS鑒定。
(2)通過大量實驗優化的通用引物適用于99%以上的微生物，鑒定成功率在95%以上。常規鑒定內容有形態特征和理化特性。形態特征包括顯微形態和培養特征；理化特性包括營養類型、碳氮源利用能力、各種代謝反應、酶反應和血清學反應等。
(3)BIOLOG鑒定系統以微生物對不同碳源的利用情況為基礎，檢測微生物的特征指紋圖譜，建立與微生物種類相對應的數據庫。通過軟件將待測微生物與數據庫參比，得出鑒定結果。該系統已獲美國FDA認可，已逐步應用于食品和飲品企業、環保、海洋生物/水產品、制藥、農業微生物、生物治理、化妝品、臨床等領域的微生物鑒定試驗中。
二、鑒定領域：API鑒定系統涵蓋15個鑒定系列，約有1000種生化反應，已可鑒定超過600種的細菌。鑒定過程中，可根據細菌所屬類群選擇適當的生理生化鑒定系列，通過軟件將待測細菌與數據庫參比，得出鑒定結果。可應用API50CH系列、API20E系列、APIStaph系列對乳酸桿菌(Lactobacillussp.)和相關細菌、芽孢桿菌(Bacillussp.)、葡萄球菌屬(Staphylococcussp.)、微球菌屬(Micrococcussp.)和庫克菌屬(Locuriasp.)進行鑒定。
